ehrapy.anndata.anndata_to_df#
- ehrapy.anndata.anndata_to_df(adata, layer=None, obs_cols=None, var_cols=None)[source]#
Transform an AnnData object to a pandas dataframe.
- Parameters:
- Return type:
- Returns:
The AnnData object as a pandas Dataframe
Examples
>>> import ehrapy as ep >>> adata = ep.dt.mimic_2(encoded=True) >>> df = ep.ad.anndata_to_df(adata)